쿠스코는 페루 남동부 안데스산맥의 우루밤바(Urubamba) 계곡 지역 해발 3,399m 지점의 분지에 있는 잉카제국의 수도로서 한때 1백만 명이 거주하였다. 쿠스코는 케추아어로 '세계의 배꼽'이라는 뜻이다. 13세기부터 잉카제국의 수도로 자리잡은 쿠스코는 잉카 시대 때 쿠스코는 정치 및 종교 엘리트가 살았던 지역의 중심지였다. 그러나 1533년 프란스시코 피사로가 이끄는 스페인 정복자들에 의해 식민화되기 시작했다.

식민시기 리마가 스페인의 식민 도시로 자리잡으면서 쿠스코의 중요성이 약화되었고, 이러한 경향은 독립한 이후에도 19~20세기 동안 이어졌다. 페루의 남부 주요 도시로 지위를 유지했지만, 페루 제2의 수도인 아레키파에 비해 중요성이 덜했다. 1911년 하이럼 빙햄 원정대가 마추픽추라는 잉카 유적지를 발견하면서 이후 관광 산업의 중심지로 자리잡았다. 1944년에 6월 24일을 쿠스코의 날로 지정하여 매년 인티라이미 축제를 거행하기 시작했다. 1950년 발생한 지지으로 도시 구조물의 1/3 이상이 피해를 입으면서 시작된 도시 재건 작업은 쿠스코 도시 근대화의 시발점이 되었다. 1972년 쿠스코의 유적 지역은 국가 문화유산으로 지정되었고, 1983년 유네스코 문화유산으로 지정되었다. 1990년대에 들어서면서 쿠스코는 페루를 대표하는 관광지로 발돋움했다.

쿠스코는 남동부 고산지대에 위치하고 있어, 전통적으로 좌파 정당이 강세를 보였다. 

해발고도 3,399m 지점에 위치한 쿠스코는 아열대성 고산 기후로 건기와 우기의 두 계절이 있다. 주민 대부분은 메스티소와 원주민으로 구성된다. 주요 경제 활동으로는 농업, 식품 및 음료 산업, 관광산업이 있다.

쿠스코의 국제공항은 1967년 개장한 알레한드로 벨라스코 아스테테 국제공항이며, 항공로 이외에 철도와 버스가 쿠스코와 다른 도시를 연결해주는 주요 교통수단이다.