제주특별자치도에서는 2015년 축산조수입 1조원, 농가소득 2억원 달성을 위하여 2009년도에는 2008년 보다 16% 증가한 177개사업에 91,406백만원을 투자 할 계획이다. 축산업을 2.3차 융.복합산업으로 육성한다는 목표 아래 2009도 중점 시책으로는 ○ 2ㆍ3차 융ㆍ복합 사업추진 ○ 제주청청축산물 유통특구 지정 ○ 돼지고기대일수출 및 가금전염병 청정화지역 선포 ○ 축종별 여건과 특성극대화 ○ 녹색축산사업장 조성기반 구축으로 지역경제를 활성화하는 효자산업으로 정착시킬 계획이다. 2009년도 분야별 추진계획은 제주 축산물 유통 특구화를 위하여 20개사업에 5,012백만원을 투자하여 - 보들결 제주한우, 제주토종닭 특구지정하고, 연차별로 우유, 치즈, 계란, 말고기, 흑돼지 특구로 확대하기 위하여 특구 운영규정 및 특구운영위원회를 구성 할 계획이며, 제주산 축산물 유통혁신체계 구축, 스타 마켓팅으로 유통망 확대 등을 통한 글로벌 브랜드로 육성 할 계획이다. 돼지고기 대일 수출 및 가금전염병 청정화지역 선포 등을 위하여 26개사업에 2,808백만원을 투자하여 - 돼지열병 근절에 따른 돼지열병 항체 집중 감시체계 구축, 돼지고기 T/F팀 운영, 가금전염병 청정화 선포로 “가축전염병 Free Zone 제주” 구현으로 제주청정 축산물의 브랜드파원 업그래이드 할 계획이다. 축종별 여건과 특성극대화를 위하여 70개사업에 29,363백만원을 투자하여 - FTA 대응 제주흑우 전략적 육성, 마필 신성장 동력산업 육성, 흑돼지 농촌 활력화 증진 향토산업 육성, 닭고기, 토종닭, 계란 기능성 식품 육성 등을 통한 축산업경쟁력을 강화 할 계획이다. 녹색 축산사업장 조성기반 구축을 위하여 38개사업에 34,589백만원을 투자하여 - 온실가스 감축위한 저탄소 축산사업장 구축, 초지.사료작물.청보리 재배 확대, 양돈분뇨 바이오가스 플랜트 시범사업 추진 등을 통한 녹색사업장 조성으로 제2 녹색혁명 원년의 해를 구축 할 계획이다. 이밖에 종합자금 융자지원, 축산진흥원 운영, 동물위생 시험소 운영 등 23개사업에 19,634백만원을 투자 할 계획이며, 또한 사업 조기 발주 및 사업비를 신속하게 지원하기 위하여 ‘08년 12월 중 지원계획을 수립, 농가 홍보를 강화하여 ’09년 1월까지 사업대상자 선정을 완료하여 농가불안 심리를 해소하고, ‘09년 상반기 중 사업비 60% 이상 지급 할 계획이다.