농림수산식품부는 농협 개혁의 핵심이 농협중앙회장의 전횡을 견제할 장치 마련으로 보고 현재 법제처에 넘어간 농협법 개정안을 사실상 백지화하고 원점에서부터 재검토하겠다고 밝혔다.이에 따라 법제처 검토안에서 빠진 농협 중앙회장의 대표이사 추천권 제한과 감사위원회의 독립기구화 등 관련 입법이 다시 추진된다.농식품부는 농업계와 학계 전문가 등 10여명으로 구성된 '농협개혁위원회'를 출범시키고 연말까지 농협 개혁안을 마련할 방침이다.농협은 자회사 현직 임원이 모두 사직서를 제출한 가운데 25개인 자회사를 2010년까지 16개로 줄이는 자체 개혁안을 내놓았다.또 4개 유통 자회사는 단일회사로 통합하고, 증권.선물.자산운용 등 3개 금융회사도 합치거나 수직 계열화를 추진한다.농협은 또 자회사 전체 임원의 22%인 11명을 감축하고 보수를 10% 삭감하며, 자회사 전 직원의 임금은 동결하기로 했다.